Les causes de la perte de biodiversité se trouvent dans les effets néfastes de l'élevage sur les sols et les sources en eau. La surfertilisation des sols, l'acidification des sols, la pollution de l'eau, le changement climatique et le déboisement forment un danger pour la faune et la flore. Il ne s'agit pas uniquement de la forêt amzonienne, de nombreuses variétés de plantes et d'animaux sont menacées voire ont disparu en Belgique.